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RE: F@H et coronavirus - GtevoOne82 - 07-03-2020
Merci toTOW
RE: F@H et coronavirus - toTOW - 07-03-2020
Ah oui, j'ai oublié de préciser ce sont des projets pour GPU uniquement.
RE: F@H et coronavirus - JWhy - 08-03-2020
Et si j'ai tout compris, il faut avoir , dans la config, une "Cause preference" à "Any" pour avoir plus de chances d'avoir des WU pour cette recherche.
RE: F@H et coronavirus - toTOW - 08-03-2020
Oui, il faut se mettre en "Any".
Elle pourrait apparaitre, mais probablement pas de si tôt : il faut mettre à jour le client actuel pour ajouter une cause ... et c'est pas la priorité, il y a un client complètement nouveau en développement.
On me souffle dans l'oreillette que des projets CPU sont envisagés aussi ! On verra si ça aboutis ...
RE: F@H et coronavirus - DK-tastrophe - 09-03-2020
(06-03-2020 00:00:48)Patachon a écrit : Peut-être un lien avec la mise en hibernation de Seti@Home ?Une bonne chose, ça...
https://setiathome.ssl.berkeley.edu/
Le coronavirus est évidemment super à la mode, mais perso il ne m'inquiète pas tellement. Tant mieux par contre s'il mobilise de nouvelles ressources pour la recherche médicale.
Par contre, venant de visiter il y a quelques jours l'unité Alzheimer d'un EHPAD et un service hospitalier d'oncologie, franchement, mon hérédité commence à me faire trembler...
RE: F@H et coronavirus - GtevoOne82 - 09-03-2020
Un petit lien sur l'évolution dans le monde du virus
https://www.gisaid.org/epiflu-applications/global-cases-covid-19/
RE: F@H et coronavirus - Thor - 09-03-2020
(09-03-2020 12:38:14)DK-tastrophe a écrit : Le coronavirus est évidemment super à la mode, mais perso il ne m'inquiète pas tellement. Tant mieux par contre s'il mobilise de nouvelles ressources pour la recherche médicale.Pareil, étant en bonne santé, il ne m'inquiète pas plus que ça directement, mais c'est le fait d’être potentiellement contaminant sans savoir qu'on l'est qui me fait rester prudent.
Par contre, venant de visiter il y a quelques jours l'unité Alzheimer d'un EHPAD et un service hospitalier d'oncologie, franchement, mon hérédité commence à me faire trembler...
J'espère que les urgences ne vont pas se retrouver trop débordées, mais je ne me fais pas trop d'illusion, ce n’est pas le moment de se casser une jambe.
Pour le reste, j'ai la chance de ne pas avoir de cas d'Alzheimer dans mon entourage proche *touche du bois*, mais pour ce qui est du cancer...
RE: F@H et coronavirus - toTOW - 09-03-2020
C'est parti, les projets arrivent en bêta. Si tout va bien, ils seront distribués à tous dès demain !
Citation :Je vous traduit l'annonce du chercheur avec la description de chaque projet :
Merci à tous pour votre patience pendant que nous avons passé une semaine à décider comment utiliser au mieux la puissance supplémentaire exceptionnelle que nous avons obtenue de vous tous qui souhaitez aider dans la lutte contre le coronavirus. Nous nous somme concentrés sur 6 projets actuellement et il y a beaucoup de nouvelles données biochimiques à venir avec lesquelles nous allons probablement préparer de nouveaux projets.
Voici de courtes descriptions des projet. Merci de nous laisser quelques jours de plus afin de vous concocter un post complet sur le blog décrivant ce que nous espérons atteindre avec ces projets. En général, nous recherchons des conformations alternatives et des poches cachées dans les cibles de médicaments les plus prometteurs, ce qui ne peut se voir qu’en simulation et non dans les modèles statiques (note aux spécialistes, le texte original : static crystal / cryo-EM structures). Il y des données très récentes issues des dépistages maintenant disponible pour certaines d’entre elles (note : les cibles de médicaments) que nous utiliserons pour valider les simulations et aider au dépistage direct. La collecte d’un maximum de données aussi rapidement que possible sera crucial, merci encore à vous tous de rendre ceci possible !
Tous les projets utilisent le nouveau core GPU OpenMM 22.
- 11741: domaine de liaison au récepteur du coronavirus SARS-CoV-2 (causant le virus COVID-19) en complexe avec le récepteur humain ACE2. atomes: 165550, crédit: 15396
- 11742: protéase du coronavirus SARS-CoV-2 (causant le virus COVID-19) en complexe avec un inhibiteur. atomes: 62227, crédit: 9405
- 11743: protéase du coronavirus SARS-CoV-2 (causant le virus COVID-19) - cible médicamenteuse potentielle. atomes: 62180, crédit: 9405
- 11744: domaine de liaison au récepteur du coronavirus SARS-CoV (virus provoquant le SRAS) piégé par un anticorps SARS-CoV S230. atomes: 109578, crédit: 7608
- 11745: domaine de liaison au récepteur du coronavirus SARS-CoV (virus provoquant le SRAS) muté en SARS-CoV-2 (virus provoquant COVID-19) piégé par un anticorps SARS-CoV S230. atomes: 110370, crédit: 7685
- 11746: domaine de liaison au récepteur du coronavirus SARS-CoV-2 (causant le virus COVID-19) en complexe avec le récepteur humain ACE2 (structure alternative à 11741). atomes: 182699, crédit: 16615
Si vous voyez des erreurs de traduction ou que vous avez de meilleures formulations à proposer, n'hésitez pas !
HS : l'éditeur visuel du forum est vraiment pas formidable
RE: F@H et coronavirus - Thor - 09-03-2020
Message passé sur Zébulon
RE: F@H et coronavirus - GtevoOne82 - 09-03-2020
Merci pour l'info toTOW